حرصاً من الصندوق على معالجة بعض مكامن الضعف التي يعاني منها القطاع الزراعي، أطلق الصندوق قبل عدة سنوات المبادرات السبع بهدف المساهمة في التغلب على التحديات التي تواجه القطاع الزراعي وهي:
- مبادرة مركز المعلومات الزراعية (منار).
- مبادرة ترشيد استخدام المياه في المحاصيل الزراعية الأخرى (عدا القمح والأعلاف الخضراء).
- مبادرة تطوير أساليب المناولة والتسويق للمحاصيل الزراعية (الخضار والفاكهة).
- مبادرة رفع كفاءة قطاع الدواجن.
- مبادرة تطوير قطاع النخيل والتمور.
- مبادرة إكثار وتحسين الأغنام.
- مبادرة تطوير قطاع الثروة السمكية.
وقد تم الانتهاء من الدراسات الاستشارية لهذه المبادرات واحيلت لوزارة البيئة والمياه والزراعة بحسب الاختصاص.
وكانت توصيات هذه المبادرات أحد المصادر المهمة لاستراتيجية الصندوق ومدخلاً مهماً لاستراتيجية الوزارة ومبادراتها في برنامج التحول الوطني، وخاصة قطاع الري والتسويق الزراعي، ودعم وتطوير قطاع النخيل والتمور، وتطوير قطاع الثروة السمكية والاستزراع المائي، وقطاع الثروة الحيوانية.